Предварительные данные о распределении мтДНК линий красно-серой полевки (Craseomys rufocanus Sundevall, 1846) на юго-западе Приморского края
DOI:
https://doi.org/10.33910/2686-9519-2024-16-4-832-838Ключевые слова:
красно-серая полевка, Craseomys rufocanus, мтДНК, филогенетические группы, Приморский крайАннотация
Проведен анализ изменчивости фрагмента гена цитохрома b (cytb) у красно-серой полевки (Craseomys rufocanus) на юго-западе Приморья. Обнаружено шестнадцать новых для вида гаплотипов, относящихся к двум филогруппам. Показана целесообразность выделения F-гаплотипов в отдельную филогенетическую группу и подразделенность филогруппы D на две подгруппы. Получены предварительные данные о распределении мтДНК линий на юге края. Обнаружена тенденция к снижению частоты встречаемости С-2-гаплотипов с севера на юг и D-гаплотипов с запада на восток. Показано присутствие только D-гаплотипов на юго-западе Приморья, что указывает на барьерную роль Суйфуно-Ханкайской равнины для распространения красно-серой полевки.
Библиографические ссылки
Abramson, N. I., Abramov, A. V., Baranova, G. I. (2009) New species of red-backed vole (Mammalia: Rodentia: Cricetidae) in fauna of Russia: Molecular and morphological evidences. Proceedings of the Zoological Institute of the Russian Academy of Sciences, vol. 313, no. 1, pp. 3–9. https://doi.org/10.31610/trudyzin/2009.313.1.3 (In English)
Abramson, N. I., Petrova, T. V., Dokuchaev, N. E. et al. (2012) Phylogeography of the gray red-backed vole Craseomys rufocanus (Rodentia: Cricetidae) across the distribution range inferred from nonrecombining molecular markers. Russian Journal of Theriology, vol. 11, no. 2, pp. 137–156. (In English)
Abramson, N. I., Tursunova, L. S., Petrova, T. V. et al. (2023) Colonization history of the grey red-backed vole Craseomys rufocanus on Iturup island inferred from the analysis of the cytochrome b (cytb) gene fragment. Russian Journal of Genetics, vol. 59, no. 8, pp. 824–830. (https://doi.org/10.1134/S1022795423080021 (In English)
Aljanabi, S. M., Martinez, I. (1997) Universal and rapid salt-extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques. Nucleic Acids Research, vol. 25, no. 22, pp. 4692–4693. https://doi.org/10.1093/nar/25.22.4692 (In English)
Bandelt, H. J., Forster, P., Röhl, A. (1999) Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies. Molecular Biology and Evolution, vol. 16, no. 1, pp. 37–48. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a026036 (In English)
Cook, J. A., Runck, A. M., Conroy, C. J. (2004) Historical biogeography at the crossroads of the northern continents: Molecular phylogenetics of red-backed voles (Rodentia: Arvicolinae). Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 30, no. 3, pp. 767–777. https://doi.org/10.1016/S1055-7903(03)00248-3 (In English)
Davis, M. B., Shaw, R. G. (2001) Range shifts and adaptive responses to Quaternary climate change. Science, vol. 292, no. 5517, pp. 673–679. https://doi.org/10.1126/science.292.5517.673 (In English)
Dekonenko, A., Yakimenko, V., Ivanov, A. et al. (2003) Genetic similarity of Puumala viruses found in Finland and western Siberia and of the mitochondrial DNA of their rodent hosts suggests a common evolutionary origin. Infection, Genetics and Evolution, vol. 3, no. 4, pp. 245–257. https://doi.org/10.1016/S1567-1348(03)00088-1 (In English)
Glushkova, O. Yu. (2011) Late Pleistocene glaciations in North-East Asia. In: J. Ehlers, P. L. Gibbard, P. D. Hughes (eds.). Developments in Quaternary sciences. Vol. 15. Amsterdam: Elsevier Publ., pp. 865–875. https://doi.org/10.1016/B978-0-444-53447-7.00063-5 (In English)
Hall, T. A. (1999) BioEdit: A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series, no. 41, pp. 95–98. (In English)
Harrison, S. P., Yu, G., Takahara, H., Prentice, I. C. (2001) Diversity of temperate plants in East Asia. Nature, vol. 413, no. 6852, pp. 129–130. https://doi.org/10.1038/35093166 (In English)
Hewitt, G. M. (2000) The genetic legacy of the Quaternary ice ages. Nature, vol. 405 (6789), pp. 907–913. https://doi.org/10.1038/35016000 (In English)
Hewitt, G. M. (1999) Post-glacial re-colonization of European biota. Biological Journal of the Linnean Society, vol. 68, no. 1-2, pp. 87–112. https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1999.tb01160.x (In English)
Hewitt, G. M. (2004) Genetic consequences of climatic oscillations in the Quaternary. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, vol. 359, no. 1442, pp. 183–195. https://doi.org/10.1098/rstb.2003.1388 (In English)
Iwasa, M. A., Utsumi, Y., Nakata, K. et al. (2000) Geographic patterns of cytochrome b and Sry gene lineages in the gray red-backed vole Clethrionomys rufocanus from Far East Asia including Sakhalin and Hokkaido. Zoological Science, vol. 17, pp. 477–484. (In English)
Kier, G., Kreft, H., Lee, T. M., Barthlott, W. (2009) A global assessment of endemism and species richness across island and mainland regions. PNAS, vol. 106, no. 23, pp. 9322–9327. https://doi.org/10.1073/pnas.0810306106 (In English)
Nørgaard, J., Margold, N. M., Jansen, J. D. et al. (2023) Absence of large-scale ice masses in central Northeast Siberia during the late Pleistocene. Geophysical Research Letters, vol. 50, no. 10, article e2023GL103594. https://doi.org/10.1029/2023GL103594 (In English)
Ren, G., Mateo, R. G., Liu, J. et al. (2017) Genetic consequences of Quaternary climatic oscillations in the Himalayas: Primula tibetica as a case study based on restriction site-associated DNA sequencing. New Phytologist, vol. 213, no. 3, pp. 1500–1512. https://doi.org/10.1111/nph.14221 (In English)
Sommer, R. S., Nadachowski, A. (2006) Glacial refugia of mammals in Europe: Evidence from fossil records. Mammal Review, vol. 36, no. 4, pp. 251–265. https://doi.org/10.1111/j.1365-2907.2006.00093.x (In English)
Stewart, J. R., Lister, A. M., Barnes, I., Dalén, L. (2010) Refugia revisited: Individualistic responses of species in space and time. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, vol. 277, no. 1682, pp. 661–671. https://doi.org/10.1098/rspb.2009.1272 (In English)
Загрузки
Опубликован
Выпуск
Раздел
Лицензия
Copyright (c) 2024 Шереметьева Ирина Николаевна, Шпеко Вероника Сергеевна
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial» («Атрибуция — Некоммерческое использование») 4.0 Всемирная.
Автор предоставляет материалы на условиях публичной оферты и лицензии CC BY-NC 4.0. Эта лицензия позволяет неограниченному кругу лиц копировать и распространять материал на любом носителе и в любом формате, но с обязательным указанием авторства и только в некоммерческих целях. После публикации все статьи находятся в открытом доступе.
Авторы сохраняют авторские права на статью и могут использовать материалы опубликованной статьи при подготовке других публикаций, а также пользоваться печатными или электронными копиями статьи в научных, образовательных и иных целях. Право на номер журнала как составное произведение принадлежит издателю.
